Gosick utspelar sig i ett uppdiktat Europeiskt land under 1920-talet, där vi får vi möta Kazuja Kujo som är student på St. Marguerite Academy. Där träffar han Victorique, en mystisk, men extremt intelligent tjej som spenderar sina dagar i den avskilda delen av biblioteket för att lösa mysterier som de lokala detektiverna inte kan lösa.